Deze plant verspreidt tijdens het bloeiseizoen grote hoeveelheden pollen die bij veel mensen hooikoortsklachten kunnen veroorzaken, zoals niezen, jeukende ogen, een loopneus en ademhalingsproblemen. Wat alsemambrosia bijzonder problematisch maakt, is dat de pollen zeer sterk allergeen zijn, zelfs in lage concentraties, en dat de bloeiperiode vaak later in het jaar plaatsvindt, van augustus tot oktober. Hierdoor kunnen mensen die al gevoelig zijn voor hooikoorts, extra lang last hebben van hun allergie.